Evaluación de las variables altitud y composición del suelo sobre la actividad antibacteriana y antifúngica de extractos lipofílicos de hypericum laricifolium juss por fingerprint cromatográfico
Hypericum laricifolium Juss se utiliza para el tratamiento de infecciones microbianas. Su perfil metabólico secundario es influenciado por distintas variables ambientales. Se busca evaluar el efecto de la altitud y composición de suelos sobre la actividad antibacteriana y antifúngica de extractos li...
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2017
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| author | Ortega Puma, Carmen Maribel |
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| description | Hypericum laricifolium Juss se utiliza para el tratamiento de infecciones microbianas. Su perfil metabólico secundario es influenciado por distintas variables ambientales. Se busca evaluar el efecto de la altitud y composición de suelos sobre la actividad antibacteriana y antifúngica de extractos lipofílicos de Hypericum laricifolium evaluando 29 individuos y sus muestras de suelo recolectados en diferentes ambientes, y construir un modelo predictivo de su efecto utilizando fingerprint cromatográfico mediante HPLC. En el suelo se analizaron pH, conductividad eléctrica, materia orgánica, nitrógeno, fósforo y potasio. Los extractos se obtuvieron mediante fluidos supercríticos. Para la identificación molecular se secuenciaron los loci para ITS1, ITS2 y rbcL. La identidad para ITS1 e ITS2 fue del 100% y 99,7% respectivamente, rbcL mostró identidad de género (98,5%). La actividad antibacteriana fue evaluada mediante microdilución en placa frente a SARM, evidenciando alta actividad. Mediante mínimos cuadrados parciales (PLS) se estableció correlación entre la actividad antibacteriana y los perfiles cromatográficos a 254, 280 y 360 nm. El modelo fue construido usando los individuos con sus réplicas, con 7501 variables X (respuestas en los diferentes tiempos de retención), variable y (CI50 de cada individuo) y fue evaluado usando parámetros de correlación R2. El modelo a 254 nm predijo mejor la actividad antibacteriana (R2=0,92). |
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| spelling | oai:dspace.ucuenca.edu.ec:123456789-280412017-09-06T13:04:04Z Evaluación de las variables altitud y composición del suelo sobre la actividad antibacteriana y antifúngica de extractos lipofílicos de hypericum laricifolium juss por fingerprint cromatográfico Ortega Puma, Carmen Maribel León Tamariz, Fabián Santos Ordoñez, Efrén Germán Ortiz Ulloa, Silvia Johana Altitud Codigo De Barra Molecular Composicion Suelo Efecto Antimicrobiano Tesis De Maestria En Biociencias Aplicadas Hypericum laricifolium Juss se utiliza para el tratamiento de infecciones microbianas. Su perfil metabólico secundario es influenciado por distintas variables ambientales. Se busca evaluar el efecto de la altitud y composición de suelos sobre la actividad antibacteriana y antifúngica de extractos lipofílicos de Hypericum laricifolium evaluando 29 individuos y sus muestras de suelo recolectados en diferentes ambientes, y construir un modelo predictivo de su efecto utilizando fingerprint cromatográfico mediante HPLC. En el suelo se analizaron pH, conductividad eléctrica, materia orgánica, nitrógeno, fósforo y potasio. Los extractos se obtuvieron mediante fluidos supercríticos. Para la identificación molecular se secuenciaron los loci para ITS1, ITS2 y rbcL. La identidad para ITS1 e ITS2 fue del 100% y 99,7% respectivamente, rbcL mostró identidad de género (98,5%). La actividad antibacteriana fue evaluada mediante microdilución en placa frente a SARM, evidenciando alta actividad. Mediante mínimos cuadrados parciales (PLS) se estableció correlación entre la actividad antibacteriana y los perfiles cromatográficos a 254, 280 y 360 nm. El modelo fue construido usando los individuos con sus réplicas, con 7501 variables X (respuestas en los diferentes tiempos de retención), variable y (CI50 de cada individuo) y fue evaluado usando parámetros de correlación R2. El modelo a 254 nm predijo mejor la actividad antibacteriana (R2=0,92). Hypericum laricifolium Juss is used for the treatment of microbial infections. The secondary metabolic profile and hence the biological activity could be influenced by several environmental variables. The aim of this work was to evaluate the effect of altitude and soil compositions on the antibacterial and antifungal activity of lipophilic extracts of Hypericum laricifolium, by evaluating 29 individuals and their soil samples obtained in different environmental conditions and to get a predictive model of their effect using fingerprint chromatography by HPLC. Soil samples were analyzed for pH, electrical conductivity, organic matter, nitrogen, phosphorus and potassium. The extracts were obtained by supercritical fluid extraction. For molecular identification, the loci ITS1, ITS2 and rbcL were sequenced. The identity for ITS1 and ITS2 was 100% and 99.7% respectively, rbcL exhibited genus identity (98,5%). The antibacterial activity was performed by micro-dilution technique against MRSA. A high activity has been detected. Using partial least squares (PLS) a correlation was established between antibacterial activity and chromatographic profiles at 254, 280 and 360 nm. The model was constructed using the individuals with their replicas, with 7501 X variables (responses at different retention times), variable y (IC50 of each individual). The model was evaluated using R2 correlation parameters, the model at 254 nm predicted better the antibacterial activity (R2=0.92). Magíster en Biociencias Aplicadas Cuenca 2017-09-04T15:50:54Z 2017-09-04T15:50:54Z 2017-09-01 masterThesis Ensayos y artículos académicos o científicos http://dspace.ucuenca.edu.ec/handle/123456789/28041 spa TM4;1203 application/pdf application/pdf |
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