| Summary: | El presente estudio se enfocó en la caracterización molecular de un grupo de asilados fungales potencialmente micorrízicos que fueron provistos por la Universidad de Cuenca. Se trata de hongos aislados a partir de diez especies de orquídeas nativas del Ecuador de dos regiones: de las cuales cinco corresponde al sector Remigio Crespo Toral Cantón Gualaceo (Provincia del Azuay), y cinco fueron recolectadas del Cerro Abuga en la parroquia Bayas del Cantón Azogues (Provincia del Cañar). El ADN objeto de estudio fue obtenido a partir del repique de la colección de hongos que se mantiene en el orquideario de la Universidad de Cuenca ubicada en el campus de Balzay. La región ITS de los genes ribosomales nucleares se amplificó por PCR usando la combinación de primers ITS1 y TW14 que dan un producto alrededor de 1200pb. Estos productos fueron analizados mediante electroforesis y secuenciados en el Departamento de Genética de la Universidad de Osnabrück, Alemania. Finalmente, se compararon con bases de datos disponibles en el GenBank, mediante una búsqueda a través de la herramienta bioinformática BLAST. Los resultados reportan dos especies micorrízicas, Ceratobasidium sp. asociada a la raíz de Trichoceros antenniferum, recolectada a (2.330 m.s.n.m.), y Sebacina vermifera asociada a la raíz de Epidendrum sp. recolectada a (3.090 m.s.n.m.). Esta investigación se podría integrar para posteriores estudios de germinación de dichos hongos micorrizicos con diferentes orquídeas para la conservación de la misma.
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