| Summary: | El cultivo de naranjilla en Ecuador tiene un gran potencial debido a sus excelentes características organolépticas. Sin embargo, es muy susceptible al ataque del nematodo Meloidogyne incognita, en ocasiones causando la pérdida total del cultivo. Esta investigación se llevó a cabo bajo invernadero con objetivo de determinar la resistencia a Meloidogyne incognita, en tres especies de la sección Lasiocarpa: S. quitoense, S. hirtum y Solanum sp; y, buscar marcadores moleculares RGAs y SSR asociados a la resistencia. Para el análisis fenotípico se utilizó un diseño completamente al azar con cinco repeticiones, y en el análisis molecular se consideró el polimorfismo basado en ausencia o presencia de productos de amplificación. El inoculo fue extraído de raíces infectadas de naranjilla, el cual fue utilizado para infectar las tres especies. Para los análisis moleculares se utilizaron primers RGAs y SSR definidos sobre regiones de homología en genes de resistencia en diferentes cultivos. Se encontró que para las variables biomasa acumulada, aumento de la población, incidencia, índice de nudosidad y severidad, los resultados mostraron diferencias altamente significativas entre S. hirtum y Solanum sp. con respecto a la especie susceptible (S. quitoense) a los 80 días de evaluación. En cuanto a los marcadores moleculares se encontró dos pares de primers que amplificaron en S. hirtum y S. quitoense: un RGA definido sobre un dominio LRR y un SSR definido en pimiento. No se obtuvo amplificaciones en Solanum sp. Además, estos primers resultaron ser polimórficos en la población segregante entre S. quitoense y S. hirtum.
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