“Determinación de la resistencia a Meloidogyne incognita, en tres especies de la sección Lasiocarpa: Solanum quitoense, Solanum hirtum y Solanum sp.”
El cultivo de naranjilla en Ecuador tiene un gran potencial debido a sus excelentes características organolépticas. Sin embargo, es muy susceptible al ataque del nematodo Meloidogyne incognita, en ocasiones causando la pérdida total del cultivo. Esta investigación se llevó a cabo bajo invernadero co...
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2019
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| author | Pacheco Atariguana, Luis Daniel |
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| description | El cultivo de naranjilla en Ecuador tiene un gran potencial debido a sus excelentes características organolépticas. Sin embargo, es muy susceptible al ataque del nematodo Meloidogyne incognita, en ocasiones causando la pérdida total del cultivo. Esta investigación se llevó a cabo bajo invernadero con objetivo de determinar la resistencia a Meloidogyne incognita, en tres especies de la sección Lasiocarpa: S. quitoense, S. hirtum y Solanum sp; y, buscar marcadores moleculares RGAs y SSR asociados a la resistencia. Para el análisis fenotípico se utilizó un diseño completamente al azar con cinco repeticiones, y en el análisis molecular se consideró el polimorfismo basado en ausencia o presencia de productos de amplificación. El inoculo fue extraído de raíces infectadas de naranjilla, el cual fue utilizado para infectar las tres especies. Para los análisis moleculares se utilizaron primers RGAs y SSR definidos sobre regiones de homología en genes de resistencia en diferentes cultivos. Se encontró que para las variables biomasa acumulada, aumento de la población, incidencia, índice de nudosidad y severidad, los resultados mostraron diferencias altamente significativas entre S. hirtum y Solanum sp. con respecto a la especie susceptible (S. quitoense) a los 80 días de evaluación. En cuanto a los marcadores moleculares se encontró dos pares de primers que amplificaron en S. hirtum y S. quitoense: un RGA definido sobre un dominio LRR y un SSR definido en pimiento. No se obtuvo amplificaciones en Solanum sp. Además, estos primers resultaron ser polimórficos en la población segregante entre S. quitoense y S. hirtum. |
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| institution | Universidad de Cuenca |
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| spelling | oai:dspace.ucuenca.edu.ec:123456789-333742020-08-03T15:11:23Z “Determinación de la resistencia a Meloidogyne incognita, en tres especies de la sección Lasiocarpa: Solanum quitoense, Solanum hirtum y Solanum sp.” Pacheco Atariguana, Luis Daniel Castro Quezada, Patricio Salvador Ingenieria Agronomica Marcadores Moleculares Meloidogyne Incognita El cultivo de naranjilla en Ecuador tiene un gran potencial debido a sus excelentes características organolépticas. Sin embargo, es muy susceptible al ataque del nematodo Meloidogyne incognita, en ocasiones causando la pérdida total del cultivo. Esta investigación se llevó a cabo bajo invernadero con objetivo de determinar la resistencia a Meloidogyne incognita, en tres especies de la sección Lasiocarpa: S. quitoense, S. hirtum y Solanum sp; y, buscar marcadores moleculares RGAs y SSR asociados a la resistencia. Para el análisis fenotípico se utilizó un diseño completamente al azar con cinco repeticiones, y en el análisis molecular se consideró el polimorfismo basado en ausencia o presencia de productos de amplificación. El inoculo fue extraído de raíces infectadas de naranjilla, el cual fue utilizado para infectar las tres especies. Para los análisis moleculares se utilizaron primers RGAs y SSR definidos sobre regiones de homología en genes de resistencia en diferentes cultivos. Se encontró que para las variables biomasa acumulada, aumento de la población, incidencia, índice de nudosidad y severidad, los resultados mostraron diferencias altamente significativas entre S. hirtum y Solanum sp. con respecto a la especie susceptible (S. quitoense) a los 80 días de evaluación. En cuanto a los marcadores moleculares se encontró dos pares de primers que amplificaron en S. hirtum y S. quitoense: un RGA definido sobre un dominio LRR y un SSR definido en pimiento. No se obtuvo amplificaciones en Solanum sp. Además, estos primers resultaron ser polimórficos en la población segregante entre S. quitoense y S. hirtum. The naranjilla crop has a great potential in Ecuador, due to its excellent organoleptic characteristics. Nevertheless, the crop has a high susceptibility to attack of nematode Meloydogyne incognita, sometimes occasioning the total loss of crop. This research was carried out under greenhouse and the objectives were: determine the resistance to Meloidogyne incognita, in three species of the Lasiocarpa section: S. quitoense, S. hirtum and Solanum sp; and, find RGAs and SSR molecular markers associated with resistance. For phenotypic analysis, a completely randomized design with five repetitions was used, and for molecular analysis the polymorphism based on absence or presence of amplification products was considered. Nematode inoculum was extracted from roots infected with naranjilla. For molecular analyzes, we used RGAs and SSR primers defined on homology regions for crop resistance genes previously identified. We found that for variables: accumulated biomass, population increase, incidence, index of knotty and severity, results showed highly significant differences between S. hirtum and Solanum sp. with respect to susceptible specie (S. quitoense) at 80 days of evaluation. Regarding the molecular markers, we found two pairs of primers that amplified in S. hirtum and S. quitoense: an RGA defined on an LRR domain and an SSR defined in pepper. No amplifications were obtained in Solanum sp. Furthermore, these primers were found to be polymorphic in the segregating population between S. quitoense and S. hirtum. Ingeniero Agrónomo Cuenca 2019-09-07T15:05:34Z 2019-09-07T15:05:34Z 2019-09-06 bachelorThesis http://dspace.ucuenca.edu.ec/handle/123456789/33374 spa TAG;389 application/pdf application/pdf |
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