| Summary: | El objetivo de esta investigación fue caracterizar genéticamente mediante mtDNA D-loop, los gallos de pelea en los diferentes criaderos del cantón Cuenca, provincia del Azuay, Ecuador. Se realizó una muestra piloto en 10 criaderos del cantón para determinar la existencia de los ecotipos de gallos de pelea y cuantificar sus efectivos respectivos. Para el criterio de ecotipos se tuvo en cuenta la información del criador, morfología externa de las aves, el trabajo de comparación de fotos con las referencias bibliográficas y el criterio de un experto. Posteriormente se seleccionaron 15 aves de los tres ecotipos más abundantes y más distribuidos en los criaderos visitados; en los que destacan: ecuatorianos, chilenos y portorriqueños de los cuales se tomaron plumas de cada animal. Además, se incluyó ADN de gallos cubanos, (out). Se determinaron el 𝐹st, el Nst y el AMOVA. Los ecotipos de gallos ecuatorianos, chilenos, portorriqueños y cubanos mostraron poca variabilidad entre ellos, 5%. La mayor variabilidad se encontró dentro de cada ecotipo. En los 19 haplotipos solo en uno se encuentran representados los 4 ecotipos, la mayoría de ellos están representados por un solo individuo. En los parámetros genéticos como: sitios de segregación, número de haplotipos, diversidad de haplotipos y promedio de las diferencias del número de nucleótidos, el ecotipo cubano, presentó valores superiores a los ecotipos restantes.
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