Perfiles de metilación en la región promotora de IL10 en saliva de niños asmáticos
Antecedentes: Existe limitada información disponible sobre estudios epigenéticos asociados a asma en poblaciones andinas de Latinoamérica. Objetivo: Identificar y comparar el porcentaje de metilación del ADN en la región promotora del gen codificador para IL10 en búsqueda de diferencias asociadas...
| Main Author: | |
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| Other Authors: | |
| Format: | masterThesis |
| Language: | spa |
| Published: |
Universidad de Cuenca
2020
|
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| Online Access: | http://dspace.ucuenca.edu.ec/handle/123456789/35214 |
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|---|---|
| author | Ochoa Avilés, María Cristina |
| author2 | Neira Molina, Vivian Alejandra |
| author_facet | Neira Molina, Vivian Alejandra Ochoa Avilés, María Cristina |
| author_sort | Ochoa Avilés, María Cristina |
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| description | Antecedentes: Existe limitada información disponible sobre estudios epigenéticos asociados a
asma en poblaciones andinas de Latinoamérica.
Objetivo: Identificar y comparar el porcentaje de metilación del ADN en la región promotora
del gen codificador para IL10 en búsqueda de diferencias asociadas con un fenotipo de asma
entre niños asmáticos y niños libres de la enfermedad en la población cuencana.
Métodos: Se realizó un estudio de casos y controles en niños asmáticos (casos) y no asmáticos
(controles) de entre 5 a 11 años en la ciudad de Cuenca-Ecuador. Datos sobre el asma,
enfermedades alérgicas y factores de riesgo fueron recolectados mediante cuestionarios aplicados
a los padres de familia. La atopia se midió mediante pruebas cutáneas a un panel de 14
aeroalergenos. El perfil de metilación de la región promotora de IL10 se realizó mediante PCR
en tiempo real mediante un QuantStudio 12K utilizando el kit OneStep qMethyl ™. Las
diferencias en el porcentaje de metilación entre casos y controles se analizaron mediante un
modelo de regresión lineal múltiple ajustando para aquellas variables que resultaron
significativas en las pruebas T o test de Fisher.
Resultados: No se encontraron diferencias significativas en el porcentaje de metilación de la
región promotora del gen IL10 entre casos y controles (𝛃=9.33, 95% IC -3.8-22.5, P=0.16). Sin
embargo, al comparar casos y controles se observó una tendencia de mayor porcentaje de
metilación de la región promotora del gen en los casos, lo cual biológicamente estaría asociado a
una disminución en su expresión.
Conclusiones: No se encontraron asociaciones entre el perfil de metilación de la región promotora
de IL10 y asma en niños. Futuros estudios de metilación en otros genes que podrían influenciar el
curso de asma en niños deberían ser considerados. IL10 podría ser considerado como un futuro
candidato para un estudio de polimorfismos en la población, así como para análisis de miRNAs o
en su defecto mutaciones o polimorfismos en regiones intrónicas del gen. |
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| institution | Universidad de Cuenca |
| language | spa |
| publishDate | 2020 |
| publisher | Universidad de Cuenca |
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| spelling | oai:dspace.ucuenca.edu.ec:123456789-352142020-12-23T07:00:39Z Perfiles de metilación en la región promotora de IL10 en saliva de niños asmáticos Ochoa Avilés, María Cristina Neira Molina, Vivian Alejandra Ingeniería Química Problemas asmáticos Niños Cantón Cuenca Asma Antecedentes: Existe limitada información disponible sobre estudios epigenéticos asociados a asma en poblaciones andinas de Latinoamérica. Objetivo: Identificar y comparar el porcentaje de metilación del ADN en la región promotora del gen codificador para IL10 en búsqueda de diferencias asociadas con un fenotipo de asma entre niños asmáticos y niños libres de la enfermedad en la población cuencana. Métodos: Se realizó un estudio de casos y controles en niños asmáticos (casos) y no asmáticos (controles) de entre 5 a 11 años en la ciudad de Cuenca-Ecuador. Datos sobre el asma, enfermedades alérgicas y factores de riesgo fueron recolectados mediante cuestionarios aplicados a los padres de familia. La atopia se midió mediante pruebas cutáneas a un panel de 14 aeroalergenos. El perfil de metilación de la región promotora de IL10 se realizó mediante PCR en tiempo real mediante un QuantStudio 12K utilizando el kit OneStep qMethyl ™. Las diferencias en el porcentaje de metilación entre casos y controles se analizaron mediante un modelo de regresión lineal múltiple ajustando para aquellas variables que resultaron significativas en las pruebas T o test de Fisher. Resultados: No se encontraron diferencias significativas en el porcentaje de metilación de la región promotora del gen IL10 entre casos y controles (𝛃=9.33, 95% IC -3.8-22.5, P=0.16). Sin embargo, al comparar casos y controles se observó una tendencia de mayor porcentaje de metilación de la región promotora del gen en los casos, lo cual biológicamente estaría asociado a una disminución en su expresión. Conclusiones: No se encontraron asociaciones entre el perfil de metilación de la región promotora de IL10 y asma en niños. Futuros estudios de metilación en otros genes que podrían influenciar el curso de asma en niños deberían ser considerados. IL10 podría ser considerado como un futuro candidato para un estudio de polimorfismos en la población, así como para análisis de miRNAs o en su defecto mutaciones o polimorfismos en regiones intrónicas del gen. Background: There is limited information available on epigenetic studies associated with asthma in Andean populations of Latin America. Objective: To identify and compare the percentage of DNA methylation in the promoter region of the gene encoding IL10 in search of differences associated with an asthma phenotype between asthmatic children and children free of the disease in the Cuenca population. Methods: A case-control study was carried out in asthmatic (cases) and non-asthmatic (controls) children between 5 and 11 years old in the city of Cuenca-Ecuador. Data on asthma, allergic diseases and risk factors were collected through questionnaires applied to the parents. Atopy was measured by skin prick tests on a panel of 14 aeroallergens. Methylation profile of the IL10 promoter region was performed by real-time PCR in a QuantStudio 12K using the OneStep qMethyl ™ kit. The differences in the percentage of methylation between cases and controls were analyzed using a multiple linear regression model, adjusting for those variables that were significant in the T tests or Fisher's test. Results: No significant differences were found in the percentage of methylation of the promoter region of the IL10 gene between cases and controls (𝛃 = 9.33, 95% CI -3.8-22.5, P = 0.16). However, when comparing cases and controls, a trend of a higher percentage of methylation of the promoter region of the gene was observed in the cases, which biologically could be associated with a decrease in its expression. Conclusions: No associations were found between the methylation profile of the IL10 promoter region and asthma in children. Future studies of methylation in other genes that could influence the course of asthma in children should be considered. IL10 could be considered as a future candidate for a study of polymorphisms in the population, as well as for the analysis of miRNAs, mutations, or polymorphisms in intronic regions of the gene. Magíster en Biociencias Aplicadas Cuenca 2020-12-18T13:50:47Z 2020-12-18T13:50:47Z 2020-12-18 masterThesis http://dspace.ucuenca.edu.ec/handle/123456789/35214 spa TM4;1778 Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ openAccess application/pdf 45 páginas application/pdf Universidad de Cuenca |
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