Protocolos de extracción de material genético de excretas de palomas (Columba livia) para la detección de hongos patógenos mediante ensayos LAMP
Los hongos patógenos son causantes de micosis infecciosas en humanos y animales. La paloma doméstica (Columba livia) es uno de los principales reservorios de estos hongos que pueden ser aspirados produciendo una serie de trastornos respiratorios y sistémicos. El objetivo de esta investigación fue ev...
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Universidad de Cuenca
2021
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| author | Corte Pérez, Angélica Lucía Sánchez Bueno, María Karina |
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| description | Los hongos patógenos son causantes de micosis infecciosas en humanos y animales. La paloma doméstica (Columba livia) es uno de los principales reservorios de estos hongos que pueden ser aspirados produciendo una serie de trastornos respiratorios y sistémicos. El objetivo de esta investigación fue evaluar protocolos para la extracción de material genético de palomas y hongos patógenos en muestras de excretas de palomas mediante 4 protocolos (A, B, C y D) con la utilización de métodos físicos, químicos y enzimáticos para después determinar la cantidad, calidad, integridad y la viabilidad del material genético obtenido con estos protocolos mediante ensayos LAMP. Los hongos patógenos son diagnosticados con técnicas de cultivo, microscopía, serología por lo que implementar una técnica de biología molecular ofrece una herramienta eficaz de diagnóstico de estos hongos en palomas y su relación con la salud pública. Para este estudio se tomaron muestras de excretas secas de los nidales y de excretas húmedas de la cloaca de las aves en puntos estratégicos de alta densidad de palomas. En el análisis estadístico de la cantidad y calidad de ADN obtenido se realizó la estimación de medias mediante el programa Ky.Plot 5.0 y la prueba de Duncan en la cual la cantidad medida mediante concentración de ADN fue mayor en los protocolos de los extractos de excretas secas que en las húmedas y la calidad para el protocolo C de excretas secas y húmedas se encontró en el parámetro ideal de ratio 260/280; con relación al análisis de integridad se realizó la tabla de contingencia de frecuencias relativas mediante el programa Infostat. Los resultados obtenidos para la amplificación por ensayos LAMP fueron negativos para cada uno de los protocolos en los dos tipos de extractos ya sea
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| spelling | oai:dspace.ucuenca.edu.ec:123456789-358482021-03-17T06:00:32Z Protocolos de extracción de material genético de excretas de palomas (Columba livia) para la detección de hongos patógenos mediante ensayos LAMP Corte Pérez, Angélica Lucía Sánchez Bueno, María Karina Méndez Álvarez, María Silvana Medicina Veterinaria Hongos patógenos Micosis infecciosas Palomas Microbiología Los hongos patógenos son causantes de micosis infecciosas en humanos y animales. La paloma doméstica (Columba livia) es uno de los principales reservorios de estos hongos que pueden ser aspirados produciendo una serie de trastornos respiratorios y sistémicos. El objetivo de esta investigación fue evaluar protocolos para la extracción de material genético de palomas y hongos patógenos en muestras de excretas de palomas mediante 4 protocolos (A, B, C y D) con la utilización de métodos físicos, químicos y enzimáticos para después determinar la cantidad, calidad, integridad y la viabilidad del material genético obtenido con estos protocolos mediante ensayos LAMP. Los hongos patógenos son diagnosticados con técnicas de cultivo, microscopía, serología por lo que implementar una técnica de biología molecular ofrece una herramienta eficaz de diagnóstico de estos hongos en palomas y su relación con la salud pública. Para este estudio se tomaron muestras de excretas secas de los nidales y de excretas húmedas de la cloaca de las aves en puntos estratégicos de alta densidad de palomas. En el análisis estadístico de la cantidad y calidad de ADN obtenido se realizó la estimación de medias mediante el programa Ky.Plot 5.0 y la prueba de Duncan en la cual la cantidad medida mediante concentración de ADN fue mayor en los protocolos de los extractos de excretas secas que en las húmedas y la calidad para el protocolo C de excretas secas y húmedas se encontró en el parámetro ideal de ratio 260/280; con relación al análisis de integridad se realizó la tabla de contingencia de frecuencias relativas mediante el programa Infostat. Los resultados obtenidos para la amplificación por ensayos LAMP fueron negativos para cada uno de los protocolos en los dos tipos de extractos ya sea excretas secas o húmedas. Pathogenic fungi are the cause of infectious mycoses in humans and animals. The domestic pigeon (Columba livia) is one of the main reservoirs of these fungi that can be aspirated producing a series of respiratory and systemic disorders. The objective of this research was to evaluate protocols for the extraction of pigeon genetic material and pathogenic fungi in pigeon excreta samples through 4 protocols (A, B, C and D) with the use of physical, chemical and enzymatic methods to later determine the quantity, quality, integrity and viability of the genetic material obtained with these protocols using LAMP assays. Pathogenic fungi are diagnosed with culture techniques, microscopy, and serology, so implementing a molecular biology technique offers an effective diagnostic tool for these fungi in pigeons and their relationship with public health. For this study, samples of dry excreta from nest boxes and wet excreta from the cloaca of birds were taken at strategic points of high density of pigeons. In the statistical analysis of the quantity and quality of DNA obtained, the estimation of means was performed using the Ky.Plot 5.0 program and Duncan`s test in which the quantity measured by DNA concentration was higher in the protocols of the dry excreta extracts than in the wet ones and the quality for the C protocol of dry and wet excreta was found in the ideal parameter of ratio 260/280; in relation of the integrity analysis, the contingency table of relative frequencies was made using the Infostat program. The results obtained for the amplification by LAMP assays were negative for each one of the protocols in the two types of extracts, whether dry or wet excreta. Médico Veterinario Zootecnista Cuenca 2021-03-12T23:36:34Z 2021-03-12T23:36:34Z 2021-03-10 bachelorThesis http://dspace.ucuenca.edu.ec/handle/123456789/35848 spa TV;374 Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ openAccess application/pdf 95 páginas application/pdf Universidad de Cuenca |
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